これの解決方法：ウィンドウ→設定→java→コンパイラ→エラー/警告→使用すべきではない制限されたAPI→禁止された参照
「この禁止された参照」で「エラー」を指定していると実行できない。よって「警告」を指定してOK。
なお、この状態でコンパイルする場合はctrl+F11を使うよりjavaファイル右クリック→実行の方が好ましい。というよりそうしないと実行できないことが多い。
このおびただしい警告数を見てもわかるように、どうも現在の環境下ではjava3Dとeclipseは相性が良いとは言えない……。
